Archives antérieures à 1792 :
Série C : Administrations provinciales,
Sous-série 1 Cd : organismes siégeant à Chambéry, cadastre sarde, 1728-1738 (1 Cd 573-575, numéros suivis ; 1 Cd1454-1458, tabelles des propriétaires)
Sous-série 1 C IV : archives de l'intendance générale de la Savoie, province du Genevois, 1703-1792
Sous-série 5 C : archives des intendances provinciales, province du Genevois, 1544-1791
Sous-série 6 C : tabellion sarde, bureau de Thônes (6 C 521-631), 1697-1796
Série G : fonds ecclésiastiques antérieurs à 1792, clergé séculier
Archives de la période révolutionnaire, 1792-1815 :
Série L : administrations et tribunaux de la période française, 1792-1815
Sous-série 2 L : organisation et administration générale, district d'Annecy, 1792-1800
Sous-série 6 L : administration municipale et de canton, district d'Annecy, 1792-1800
Sous-série 10 L : arrondissement d'Annecy, 1800-1815
Archives de la période sarde, 1815-1860 :
Série FS : administrations et tribunaux de l'époque sarde, 1814-1860
Sous-série 6 FS : affaires communales, 1815-1860
Sous-série 8 FS 1 : tabellion sarde, 1815-1860 (bureau de Thônes : 8 FS/1 3340-3494, actes publics, 1816-1840 ; 8 FS/1 3495, actes sous seing privé, 1816-1860 ; 8 FS/1 3496-3497, tables, 1852-1860).
Archives période moderne (1860-1940) :
Série M : administration générale et économie du département, 1860-1940
Sous-série 3 M : plébiscites et élections (3 M 32 : listes électorales, 1860-1940 ; 3 M 222 : élections municipales, 1860-1940)
Sous-série 6 M : population, affaires économiques, statistiques (6 M 265 : listes nominatives, 1861-1936)
Sous-série 7 M : agriculture, Eaux et Forêt (7 M 330-334 : forêt communale, 1868-1940)
Série O : administration et comptabilité communales, 1860-1940
Sous-série 2 O : administration communale, 1860-1940
Sous-série 4 O : dons et legs, 1860-1940 (4 O 675-679, Manigod, 1869-1893).
Série P : finances, cadastre, douanes, postes, 1860-1940
Sous-série 3 P : cadastre français (3 P 3 995 : état de section, 1915 ; 3 P 3 996-998 : matrices des propriétés bâties et non-bâties, 1914-1926 ; 3 P 3 999-1000 : matrices des propriétés non-bâties, 1927-1941 ; 3 P 3 1001 : matrice des propriétés bâties, 1911-1925).
Série Q : domaines, enregistrement, hypothèques de 1792-1815 et 1860-1955
Sous-série 3 Q : fonds des recettes de l'Enregistrement, 1792-1815 et 1860-1940
Sous-série 4 Q : fonds des conservations des Hypothèques, conservation d'Annecy, an IV-1961
Série R : affaires militaires et organismes de temps de guerre, 1860-1940
Sous-série 6 R : sapeurs-pompiers, 1860-1940 (6 R 27 : réorganisation du corps des sapeurs-pompiers, 1910-1911)
Série T : enseignement, affaires culturelles, sports, 1860-1940
Sous-série 1 T : enseignement, 1860-1940
Série U : justice, 1860-1940
Sous-série 4 U : justice de paix, canton de Thônes, 1860-1959
Série V : cultes, 1860-1940
Sous-série 5 V : clergé catholique régulier, 1860-1932 (5 V 41 : budgets et comptes des fabriques, 1894-1906 ; 5 V 73 : arrêtés du conseil de préfecture sur la gestion de la fabrique, 1894-1903)
Sous-série 8 V : séparation des Églises et de l'État, 1860-1940 (8 V 22 : inventaire des biens des fabriques et des menses, 1906-1948)
Série X : assistance et prévoyance sociale, 1860-1940
Sous-série 2 X : bureaux de bienfaisance et d'assistance, 1860-1940 (2 X 123 : comptes de gestion, 1860-1934 ; 2 X 230 : extraits de délibérations du bureau de bienfaisance, 1861-1925).
